そんなことも知りません
二つの違いとは、 /usr/local/apache/bin/apachectl start ←もともとのapacheの正当な起動方法。 /etc/rc.d/init.d/httpd start ← Red Hat用に誰かが作ったapacheの起動スクリプト。rcと連動しており何かと便利。 ということになります。
（ちなみに「/etc/init.d/httpd start ← Debian用に誰かが作ったapacheの起動スクリプト」です）
参考:http://okwave.jp/qa/q1237460.html
なるほどですね！！！
